2023 AACR年会,PreOmics GmbH是一家宣布启动BeatBox-based FFPE工作流、简化、加快标准化FFPE样本准备深,无偏组织蛋白质组学通过后续蛋白质消化和nanoLC-MS / MS分析。小说打击体验工作流不需要xylene-based deparaffinization,使快速、强大的并行处理的96个样本发现研究以及可再生的大群平移和临床前研究和验证。
的打击体验™组织均质器和细胞溶解是一个紧凑的、负担得起的和独立的台式系统方便,半自动样品均化各种组织和细胞类型。是从第一个到第五十个毫克灵活的输入量,持续交付的重复结果LC-MS-based蛋白质组学1 - 96样品的可伸缩的吞吐量。已经成功的对新鲜组织和细胞株蛋白质组学,与小说FFPE协议打击体验现在可以有效地处理FFPE样本下游组织蛋白质组学。声波降解法设备相比,打击体验不需要复杂的处理或额外的水处理。FFPE或新鲜冷冻组织均匀化与按钮操作只需要10分钟。
在基准研究中,FFPE以及新鲜冷冻小鼠心肌、肾脏、和肝组织(研究所提供的分子病理学在维也纳和组织学设施在维也纳BioCenter核心设施)处理使用小说打击体验FFPE工作流,以及一个声波降解法的方法。肽分析timsTOF-HT质谱仪(力量Daltonics)在DIA-PASEF模式使用30分钟缴送工作梯度。的BeatBox-based FFPE工作流显示增加蛋白质组FFPE深度,以及新鲜冷冻组织平均14%到43%,根据组织类型。典型的变异系数(CV)在复制是低于10%,强调紧凑的高重复性均化过程的打击体验乐器。此外,新方法节省了4个小时的时间相比,声波降解法工作流程,使并行高通量处理96个样本的一个工作日内。
主任Michael水坝博士哥本哈根大学蛋白质组学研究基础设施的,表示:“我们经常分析大量的组织样本,和提高我们的效率,我们已经成功地适应了打击体验技术组织均匀化。我们的最新发现是打击体验技术可以有效地同质化石蜡包埋组织卷轴。这个突破现在允许我们处理大群FFPE组织迅速,重复性良好,更精确,开放大型生物项目的可能性。利用这种技术,我们兴奋地揭示小说深刻的蛋白质组学领域的见解病理学研究。”
PreOmics首席营销官马斯坦博士说:“与我们的小说BeatBox-based FFPE工作流,研究人员终于可以简化,加速和规范FFPE样品制备,无需xylene-based deparaffinization充分利用其潜在的无偏,蛋白质组学。我们相信这是一个飞跃的准备和随后的蛋白质组学分析大样本人群。”
力量公司(纳斯达克:电流断路器)和PreOmics商业协议,使力量为销售提供BeatBox-based组织工作流与力量的timsTOF质谱仪。
看看你自己:PreOmics代表将在AACR力量布斯# 1818展示打击体验和FFPE应用笔记。应用程序可以访问https://www.preomics.com/applications/ffpe。